Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox1B1APN4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms