Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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