Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf2A2AT37 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf2A2AT37 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms