Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef17A2ASJ1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms