Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scn3aA2ASI5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms