Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Shroom2A2ALU4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shroom2A2ALU4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom2A2ALU4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms