Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SetxA2AKX3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms