Protein–RNA interactions for Protein: A2AKE5

1700003F12Rik, RIKEN cDNA 1700003F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700003F12RikA2AKE5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700003F12RikA2AKE5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700003F12RikA2AKE5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700003F12RikA2AKE5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700003F12RikA2AKE5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700003F12RikA2AKE5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700003F12RikA2AKE5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700003F12RikA2AKE5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700003F12RikA2AKE5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700003F12RikA2AKE5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
1700003F12RikA2AKE5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
1700003F12RikA2AKE5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700003F12RikA2AKE5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700003F12RikA2AKE5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700003F12RikA2AKE5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700003F12RikA2AKE5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700003F12RikA2AKE5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms