Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Frmpd1A2AKB4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms