Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VirmaA2AIV2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms