Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp8nlA2ABX0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms