Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm16A2A935 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prdm16A2A935 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm16A2A935 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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