Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav12-2A0N8N6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav12-2A0N8N6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms