Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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