Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rabgef1Q9JM13 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms