Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Hdac9Q99N13 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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