Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Apobec3Q99J72 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms