Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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