Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms