Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.03□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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