Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Trim71Q1PSW8 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Trim71Q1PSW8 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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