Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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