Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Irf5P56477 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Irf5P56477 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Irf5P56477 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Irf5P56477 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Irf5P56477 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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