Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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VdrP48281 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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VdrP48281 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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VdrP48281 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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VdrP48281 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
VdrP48281 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
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