Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm24318-201ENSMUST00000104490 131 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprmP28828 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms