Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms