Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Limd1Q9QXD8 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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Limd1Q9QXD8 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Limd1Q9QXD8 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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