Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SrfQ9JM73 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms