Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms