Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Rnft1Q9DCN7 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Rnft1Q9DCN7 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Rnft1Q9DCN7 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
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Rnft1Q9DCN7 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnft1Q9DCN7 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Rnft1Q9DCN7 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Rnft1Q9DCN7 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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