Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Obscn-201ENSMUST00000020732 23483 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc47Q9D024 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Ccdc47Q9D024 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc47Q9D024 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms