Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nup88Q8CEC0 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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