Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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