Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NischQ80TM9 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NischQ80TM9 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms