Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Usp48Q3V0C5 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Usp48Q3V0C5 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Usp48Q3V0C5 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Usp48Q3V0C5 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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Usp48Q3V0C5 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Usp48Q3V0C5 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Usp48Q3V0C5 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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