Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc34Q3UI66 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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