Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Ccndbp1Q3TVC7 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Ccndbp1Q3TVC7 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Ccndbp1Q3TVC7 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Ccndbp1Q3TVC7 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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