Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp39Q3TIX9 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms