Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprkP35822 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PtprkP35822 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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