Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprmP28828 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprmP28828 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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PtprmP28828 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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PtprmP28828 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprmP28828 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprmP28828 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprmP28828 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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