Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Vpreb1P13372 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms