Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P10404 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P10404 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms