Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PtprbB2RU80 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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PtprbB2RU80 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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PtprbB2RU80 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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PtprbB2RU80 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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PtprbB2RU80 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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PtprbB2RU80 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PtprbB2RU80 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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