Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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