Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Grik3B1AS29 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms