Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M5A7VMS3 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms