Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Btbd35f10-201ENSMUST00000178621 1952 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rtf1A2AQ19 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rtf1A2AQ19 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rtf1A2AQ19 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rtf1A2AQ19 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rtf1A2AQ19 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rtf1A2AQ19 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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