Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hdac6Q9Z2V5 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hdac6Q9Z2V5 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Hdac6Q9Z2V5 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hdac6Q9Z2V5 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hdac6Q9Z2V5 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hdac6Q9Z2V5 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Hdac6Q9Z2V5 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Hdac6Q9Z2V5 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hdac6Q9Z2V5 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hdac6Q9Z2V5 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hdac6Q9Z2V5 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hdac6Q9Z2V5 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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