Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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