Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Higd1aQ9JLR9 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.9 ms